Certaines appelettes ne sont compatibles qu'avec une version particulière de plugin java ; c'est le cas de l'application Apogée de l'université de Rennes 1 , de l'application de déclaration de revenus du Ministère des finances (parait-il).
Why do I need Java 6 Update 10 and above for Firefox 3.6 and later versions?
Starting with Firefox 3.6, Java-based applications will NOT work unless you are running Java version 6 Update 10 or newer.
Plus précisémént :
Mozilla foundation will drop support on OJI (Open Java Virtual Machine Integration) and will only support the standard NPAPI and NPRuntime interfaces. The Java Plug-in which is in Java version 6 update 10 or newer versions supports the NPAPI and NPRuntime interfaces
En gros, le plugin java installé par défaut ne marchera plus ; c'est le cas du plugin IcedTeaPlugin de opendjdk, installé par défaut sur Fedora.
How do I test whether Java is working on my computer ? : l'appelette de cette page ne fonctionne qu'avec la version ad-hoc du plugin ; si votre plugin n'est pas compatible, vous verrez un message d'erreur.
Manual Installation and Registration of Java Plugin for Linux chez oracle.
javaplugin_oji.so des répertoires de plugins firefox (/usr/lib/mozilla/plugins dans le cas d'une installation globale ou  ~/.mozilla/plugins dans le cas d'une installation individuelle)/lib/i386/libnpjp2.so où <java> est le répertoire où est installée une version de java au moins égale à 6.10.Certaines versions de linux (debian, fedora, …) utilisent un système d'alternatives (liens symboliques dans /etc/alternatives) pour créer une indirection supplémentaire ⇒ en tenir compte dans la mise à jour des liens symboliques.